Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC142Q17RM4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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