Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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CTF1Q16619 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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CTF1Q16619 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CTF1Q16619 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CTF1Q16619 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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