Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCOA1Q15788 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCOA1Q15788 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
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