Protein–RNA interactions for Protein: Q15050

RRS1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRS1Q15050 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRS1Q15050 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RRS1Q15050 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RRS1Q15050 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRS1Q15050 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRS1Q15050 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RRS1Q15050 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RRS1Q15050 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRS1Q15050 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RRS1Q15050 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRS1Q15050 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
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