Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SEMA3AQ14563 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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