Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CSHL1Q14406 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CSHL1Q14406 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms