Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PMS2P11Q13670 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms