Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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SEMA3BQ13214 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
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SEMA3BQ13214 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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SEMA3BQ13214 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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SEMA3BQ13214 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEMA3BQ13214 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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