Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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CALCOCO2Q13137 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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CALCOCO2Q13137 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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CALCOCO2Q13137 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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CALCOCO2Q13137 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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CALCOCO2Q13137 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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CALCOCO2Q13137 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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CALCOCO2Q13137 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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CALCOCO2Q13137 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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CALCOCO2Q13137 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CALCOCO2Q13137 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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