Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP4Q13115 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP4Q13115 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
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