Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTP4A2Q12974 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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