Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BPTFQ12830 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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