Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD47Q08722 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD47Q08722 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD47Q08722 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD47Q08722 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD47Q08722 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD47Q08722 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CD47Q08722 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD47Q08722 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD47Q08722 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD47Q08722 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD47Q08722 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD47Q08722 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD47Q08722 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD47Q08722 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD47Q08722 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CD47Q08722 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD47Q08722 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD47Q08722 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD47Q08722 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD47Q08722 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD47Q08722 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD47Q08722 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD47Q08722 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD47Q08722 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD47Q08722 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD47Q08722 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD47Q08722 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD47Q08722 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD47Q08722 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD47Q08722 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD47Q08722 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD47Q08722 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD47Q08722 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD47Q08722 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD47Q08722 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD47Q08722 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD47Q08722 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD47Q08722 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD47Q08722 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CD47Q08722 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD47Q08722 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD47Q08722 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD47Q08722 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD47Q08722 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD47Q08722 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD47Q08722 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD47Q08722 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD47Q08722 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD47Q08722 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD47Q08722 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD47Q08722 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD47Q08722 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD47Q08722 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD47Q08722 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD47Q08722 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CD47Q08722 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CD47Q08722 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms