Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PUDPQ08623 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms