Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNB2Q08289 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB2Q08289 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms