Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TGM3Q08188 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TGM3Q08188 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms