Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms