Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
MS4A2Q01362 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MS4A2Q01362 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms