Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL8P80075 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL8P80075 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL8P80075 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL8P80075 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL8P80075 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL8P80075 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL8P80075 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL8P80075 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL8P80075 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CCL8P80075 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCL8P80075 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCL8P80075 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CCL8P80075 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL8P80075 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL8P80075 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL8P80075 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL8P80075 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL8P80075 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL8P80075 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL8P80075 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL8P80075 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL8P80075 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL8P80075 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL8P80075 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL8P80075 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL8P80075 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL8P80075 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL8P80075 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL8P80075 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL8P80075 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL8P80075 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL8P80075 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL8P80075 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL8P80075 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL8P80075 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL8P80075 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL8P80075 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL8P80075 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL8P80075 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL8P80075 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL8P80075 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL8P80075 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL8P80075 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL8P80075 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL8P80075 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL8P80075 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL8P80075 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL8P80075 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CCL8P80075 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL8P80075 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL8P80075 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL8P80075 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL8P80075 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL8P80075 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL8P80075 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL8P80075 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL8P80075 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL8P80075 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL8P80075 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL8P80075 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL8P80075 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL8P80075 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL8P80075 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL8P80075 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL8P80075 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL8P80075 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL8P80075 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL8P80075 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL8P80075 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL8P80075 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL8P80075 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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CCL8P80075 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL8P80075 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL8P80075 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL8P80075 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL8P80075 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL8P80075 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL8P80075 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL8P80075 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL8P80075 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL8P80075 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL8P80075 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL8P80075 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL8P80075 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL8P80075 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL8P80075 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL8P80075 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL8P80075 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL8P80075 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL8P80075 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL8P80075 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CCL8P80075 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL8P80075 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL8P80075 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL8P80075 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL8P80075 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL8P80075 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CCL8P80075 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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