Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HBBP68871 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HBBP68871 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HBBP68871 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HBBP68871 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HBBP68871 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HBBP68871 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HBBP68871 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HBBP68871 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HBBP68871 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HBBP68871 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HBBP68871 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HBBP68871 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HBBP68871 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HBBP68871 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HBBP68871 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HBBP68871 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HBBP68871 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HBBP68871 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HBBP68871 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HBBP68871 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HBBP68871 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HBBP68871 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HBBP68871 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HBBP68871 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HBBP68871 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms