Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PITPNBP48739 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms