Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NESP48681 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NESP48681 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NESP48681 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NESP48681 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NESP48681 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NESP48681 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NESP48681 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NESP48681 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NESP48681 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NESP48681 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NESP48681 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NESP48681 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NESP48681 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NESP48681 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NESP48681 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NESP48681 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NESP48681 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NESP48681 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NESP48681 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NESP48681 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NESP48681 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NESP48681 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NESP48681 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NESP48681 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NESP48681 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NESP48681 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NESP48681 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NESP48681 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NESP48681 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NESP48681 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NESP48681 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NESP48681 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NESP48681 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NESP48681 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NESP48681 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NESP48681 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NESP48681 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NESP48681 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NESP48681 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NESP48681 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NESP48681 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NESP48681 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NESP48681 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NESP48681 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NESP48681 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NESP48681 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NESP48681 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NESP48681 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NESP48681 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NESP48681 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NESP48681 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NESP48681 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NESP48681 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NESP48681 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NESP48681 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NESP48681 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NESP48681 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NESP48681 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NESP48681 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NESP48681 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NESP48681 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NESP48681 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NESP48681 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NESP48681 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NESP48681 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NESP48681 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NESP48681 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NESP48681 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NESP48681 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NESP48681 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NESP48681 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NESP48681 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NESP48681 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NESP48681 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NESP48681 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NESP48681 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NESP48681 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NESP48681 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NESP48681 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NESP48681 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NESP48681 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NESP48681 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NESP48681 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NESP48681 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NESP48681 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NESP48681 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NESP48681 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NESP48681 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NESP48681 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NESP48681 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NESP48681 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NESP48681 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NESP48681 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NESP48681 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NESP48681 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NESP48681 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NESP48681 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NESP48681 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NESP48681 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms