Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 AP002986.1-201ENST00000602376 1763 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 MKL1-205ENST00000407029 4091 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 PAX8-205ENST00000429538 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
PCP4P48539 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PCP4P48539 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PCP4P48539 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PCP4P48539 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PCP4P48539 ROBO4-208ENST00000533054 3071 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PCP4P48539 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PCP4P48539 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PCP4P48539 EHD1-213ENST00000621096 3336 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PCP4P48539 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PCP4P48539 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PCP4P48539 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PCP4P48539 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PCP4P48539 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PCP4P48539 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PCP4P48539 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PCP4P48539 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PCP4P48539 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PCP4P48539 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PCP4P48539 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PCP4P48539 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PCP4P48539 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PCP4P48539 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PCP4P48539 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PCP4P48539 ATP13A2-201ENST00000326735 3840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PCP4P48539 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PCP4P48539 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PCP4P48539 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PCP4P48539 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PCP4P48539 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PCP4P48539 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PCP4P48539 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PCP4P48539 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PCP4P48539 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PCP4P48539 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PCP4P48539 ALDH8A1-203ENST00000367845 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PCP4P48539 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PCP4P48539 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
PCP4P48539 FHOD1-201ENST00000258201 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
PCP4P48539 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 PPARD-205ENST00000448077 3516 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PCP4P48539 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms