Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAD52P43351 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAD52P43351 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAD52P43351 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAD52P43351 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAD52P43351 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAD52P43351 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RAD52P43351 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD52P43351 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD52P43351 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD52P43351 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD52P43351 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD52P43351 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD52P43351 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD52P43351 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD52P43351 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD52P43351 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD52P43351 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD52P43351 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD52P43351 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD52P43351 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD52P43351 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD52P43351 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD52P43351 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD52P43351 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD52P43351 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD52P43351 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD52P43351 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD52P43351 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD52P43351 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD52P43351 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD52P43351 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD52P43351 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD52P43351 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD52P43351 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD52P43351 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD52P43351 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD52P43351 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD52P43351 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD52P43351 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD52P43351 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD52P43351 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD52P43351 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD52P43351 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD52P43351 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD52P43351 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD52P43351 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD52P43351 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD52P43351 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD52P43351 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RAD52P43351 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD52P43351 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD52P43351 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD52P43351 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD52P43351 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD52P43351 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD52P43351 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD52P43351 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD52P43351 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD52P43351 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD52P43351 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD52P43351 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD52P43351 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD52P43351 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD52P43351 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD52P43351 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD52P43351 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD52P43351 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD52P43351 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD52P43351 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD52P43351 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD52P43351 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD52P43351 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD52P43351 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD52P43351 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD52P43351 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD52P43351 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD52P43351 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD52P43351 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD52P43351 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD52P43351 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD52P43351 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD52P43351 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD52P43351 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD52P43351 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD52P43351 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD52P43351 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD52P43351 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD52P43351 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD52P43351 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD52P43351 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD52P43351 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD52P43351 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD52P43351 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD52P43351 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD52P43351 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD52P43351 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD52P43351 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD52P43351 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD52P43351 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms