Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PPARGP37231 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPARGP37231 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPARGP37231 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPARGP37231 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPARGP37231 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPARGP37231 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPARGP37231 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPARGP37231 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPARGP37231 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPARGP37231 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPARGP37231 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPARGP37231 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPARGP37231 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPARGP37231 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPARGP37231 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPARGP37231 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPARGP37231 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PPARGP37231 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPARGP37231 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPARGP37231 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PPARGP37231 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PPARGP37231 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPARGP37231 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPARGP37231 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPARGP37231 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPARGP37231 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPARGP37231 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PPARGP37231 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPARGP37231 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPARGP37231 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPARGP37231 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPARGP37231 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPARGP37231 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPARGP37231 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPARGP37231 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPARGP37231 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPARGP37231 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPARGP37231 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPARGP37231 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPARGP37231 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPARGP37231 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPARGP37231 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPARGP37231 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPARGP37231 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PPARGP37231 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PPARGP37231 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PPARGP37231 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PPARGP37231 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PPARGP37231 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PPARGP37231 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PPARGP37231 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PPARGP37231 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PPARGP37231 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PPARGP37231 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PPARGP37231 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PPARGP37231 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PPARGP37231 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PPARGP37231 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PPARGP37231 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PPARGP37231 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PPARGP37231 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PPARGP37231 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PPARGP37231 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PPARGP37231 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PPARGP37231 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PPARGP37231 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PPARGP37231 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PPARGP37231 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PPARGP37231 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PPARGP37231 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PPARGP37231 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PPARGP37231 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PPARGP37231 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PPARGP37231 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PPARGP37231 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PPARGP37231 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PPARGP37231 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PPARGP37231 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PPARGP37231 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PPARGP37231 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PPARGP37231 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PPARGP37231 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PPARGP37231 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PPARGP37231 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PPARGP37231 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PPARGP37231 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PPARGP37231 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PPARGP37231 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PPARGP37231 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PPARGP37231 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PPARGP37231 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PPARGP37231 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PPARGP37231 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PPARGP37231 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PPARGP37231 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PPARGP37231 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PPARGP37231 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PPARGP37231 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms