Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATP7BP35670 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms