Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CNGA1P29973 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CNGA1P29973 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms