Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCAP28676 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCAP28676 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCAP28676 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCAP28676 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCAP28676 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCAP28676 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCAP28676 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCAP28676 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCAP28676 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCAP28676 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCAP28676 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCAP28676 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCAP28676 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCAP28676 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCAP28676 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCAP28676 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCAP28676 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCAP28676 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCAP28676 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCAP28676 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCAP28676 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCAP28676 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCAP28676 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCAP28676 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCAP28676 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCAP28676 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCAP28676 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCAP28676 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCAP28676 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCAP28676 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCAP28676 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCAP28676 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCAP28676 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCAP28676 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCAP28676 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCAP28676 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCAP28676 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCAP28676 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCAP28676 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCAP28676 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCAP28676 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCAP28676 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCAP28676 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCAP28676 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GCAP28676 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCAP28676 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCAP28676 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCAP28676 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCAP28676 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCAP28676 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCAP28676 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCAP28676 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCAP28676 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCAP28676 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCAP28676 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCAP28676 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCAP28676 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCAP28676 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCAP28676 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCAP28676 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCAP28676 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCAP28676 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCAP28676 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCAP28676 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCAP28676 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCAP28676 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCAP28676 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCAP28676 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCAP28676 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCAP28676 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCAP28676 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCAP28676 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCAP28676 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCAP28676 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCAP28676 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCAP28676 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GCAP28676 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GCAP28676 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCAP28676 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCAP28676 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCAP28676 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCAP28676 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCAP28676 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCAP28676 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCAP28676 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCAP28676 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCAP28676 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCAP28676 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCAP28676 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCAP28676 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCAP28676 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCAP28676 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GCAP28676 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GCAP28676 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GCAP28676 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCAP28676 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCAP28676 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCAP28676 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCAP28676 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms