Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX2P28328 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX2P28328 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX2P28328 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX2P28328 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX2P28328 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX2P28328 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX2P28328 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX2P28328 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX2P28328 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX2P28328 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX2P28328 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX2P28328 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX2P28328 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX2P28328 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX2P28328 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX2P28328 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX2P28328 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX2P28328 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX2P28328 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX2P28328 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX2P28328 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX2P28328 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX2P28328 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX2P28328 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX2P28328 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX2P28328 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX2P28328 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX2P28328 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX2P28328 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX2P28328 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX2P28328 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX2P28328 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX2P28328 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX2P28328 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX2P28328 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX2P28328 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX2P28328 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX2P28328 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX2P28328 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX2P28328 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX2P28328 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX2P28328 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX2P28328 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX2P28328 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX2P28328 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX2P28328 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX2P28328 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX2P28328 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX2P28328 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX2P28328 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX2P28328 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX2P28328 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX2P28328 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX2P28328 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX2P28328 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX2P28328 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PEX2P28328 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PEX2P28328 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PEX2P28328 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PEX2P28328 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PEX2P28328 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PEX2P28328 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PEX2P28328 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PEX2P28328 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX2P28328 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX2P28328 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX2P28328 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX2P28328 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX2P28328 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX2P28328 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX2P28328 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX2P28328 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX2P28328 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX2P28328 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX2P28328 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX2P28328 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX2P28328 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX2P28328 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX2P28328 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX2P28328 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX2P28328 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX2P28328 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX2P28328 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX2P28328 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX2P28328 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX2P28328 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX2P28328 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX2P28328 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX2P28328 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX2P28328 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX2P28328 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX2P28328 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX2P28328 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX2P28328 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX2P28328 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX2P28328 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX2P28328 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX2P28328 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PEX2P28328 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms