Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGA2P17301 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms