Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms