Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK1P06493 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK1P06493 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK1P06493 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK1P06493 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK1P06493 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK1P06493 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK1P06493 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK1P06493 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK1P06493 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK1P06493 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK1P06493 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK1P06493 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK1P06493 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK1P06493 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK1P06493 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK1P06493 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK1P06493 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK1P06493 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK1P06493 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK1P06493 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK1P06493 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK1P06493 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK1P06493 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK1P06493 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK1P06493 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK1P06493 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK1P06493 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK1P06493 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK1P06493 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK1P06493 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK1P06493 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK1P06493 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK1P06493 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK1P06493 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK1P06493 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK1P06493 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK1P06493 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK1P06493 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK1P06493 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK1P06493 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK1P06493 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK1P06493 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK1P06493 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK1P06493 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK1P06493 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK1P06493 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK1P06493 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK1P06493 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK1P06493 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK1P06493 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK1P06493 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK1P06493 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK1P06493 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK1P06493 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK1P06493 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK1P06493 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK1P06493 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK1P06493 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK1P06493 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK1P06493 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK1P06493 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK1P06493 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK1P06493 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK1P06493 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK1P06493 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK1P06493 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK1P06493 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK1P06493 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK1P06493 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK1P06493 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK1P06493 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK1P06493 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK1P06493 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK1P06493 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK1P06493 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK1P06493 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK1P06493 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK1P06493 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDK1P06493 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK1P06493 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK1P06493 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK1P06493 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK1P06493 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK1P06493 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK1P06493 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK1P06493 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK1P06493 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK1P06493 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK1P06493 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK1P06493 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK1P06493 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK1P06493 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK1P06493 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK1P06493 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK1P06493 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK1P06493 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK1P06493 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK1P06493 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDK1P06493 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms