Protein–RNA interactions for Protein: O75346

ZNF253, Zinc finger protein 253, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF253O75346 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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ZNF253O75346 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ZNF253O75346 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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ZNF253O75346 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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ZNF253O75346 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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ZNF253O75346 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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ZNF253O75346 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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ZNF253O75346 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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ZNF253O75346 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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ZNF253O75346 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ZNF253O75346 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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