Protein–RNA interactions for Protein: O15066

KIF3B, Kinesin-like protein KIF3B, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3BO15066 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIF3BO15066 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIF3BO15066 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KIF3BO15066 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms