Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRPO00591 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GABRPO00591 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRPO00591 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRPO00591 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRPO00591 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRPO00591 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRPO00591 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRPO00591 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRPO00591 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRPO00591 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRPO00591 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRPO00591 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRPO00591 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRPO00591 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRPO00591 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRPO00591 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRPO00591 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRPO00591 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRPO00591 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRPO00591 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRPO00591 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRPO00591 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRPO00591 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRPO00591 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRPO00591 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRPO00591 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRPO00591 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRPO00591 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRPO00591 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRPO00591 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRPO00591 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRPO00591 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRPO00591 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRPO00591 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRPO00591 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRPO00591 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRPO00591 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRPO00591 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRPO00591 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRPO00591 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRPO00591 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRPO00591 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRPO00591 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRPO00591 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GABRPO00591 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRPO00591 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRPO00591 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRPO00591 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRPO00591 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRPO00591 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRPO00591 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRPO00591 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRPO00591 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRPO00591 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRPO00591 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRPO00591 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRPO00591 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRPO00591 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRPO00591 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRPO00591 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRPO00591 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRPO00591 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRPO00591 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRPO00591 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRPO00591 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRPO00591 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRPO00591 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRPO00591 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRPO00591 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRPO00591 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRPO00591 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRPO00591 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRPO00591 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRPO00591 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRPO00591 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRPO00591 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRPO00591 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRPO00591 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRPO00591 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRPO00591 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRPO00591 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRPO00591 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GABRPO00591 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GABRPO00591 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms