Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOC4-APOC2K7ER74 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms