Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CFAP99D6REC4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms