Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VWA8A3KMH1 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms