Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CCDC78A2IDD5 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC78A2IDD5 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms