Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDD3Q9Y3P4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms