Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM35Q9UPQ4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms