Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCSK1NQ9UHG2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCSK1NQ9UHG2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PCSK1NQ9UHG2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCSK1NQ9UHG2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCSK1NQ9UHG2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCSK1NQ9UHG2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCSK1NQ9UHG2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCSK1NQ9UHG2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCSK1NQ9UHG2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PCSK1NQ9UHG2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCSK1NQ9UHG2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCSK1NQ9UHG2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PCSK1NQ9UHG2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PCSK1NQ9UHG2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCSK1NQ9UHG2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCSK1NQ9UHG2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms