Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA9Q9UGM1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHRNA9Q9UGM1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHRNA9Q9UGM1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHRNA9Q9UGM1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHRNA9Q9UGM1 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHRNA9Q9UGM1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHRNA9Q9UGM1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHRNA9Q9UGM1 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA9Q9UGM1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA9Q9UGM1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA9Q9UGM1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA9Q9UGM1 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA9Q9UGM1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA9Q9UGM1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA9Q9UGM1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA9Q9UGM1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA9Q9UGM1 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA9Q9UGM1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA9Q9UGM1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA9Q9UGM1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA9Q9UGM1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA9Q9UGM1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA9Q9UGM1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA9Q9UGM1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA9Q9UGM1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA9Q9UGM1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA9Q9UGM1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA9Q9UGM1 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA9Q9UGM1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA9Q9UGM1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA9Q9UGM1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA9Q9UGM1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA9Q9UGM1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA9Q9UGM1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA9Q9UGM1 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA9Q9UGM1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA9Q9UGM1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA9Q9UGM1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA9Q9UGM1 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA9Q9UGM1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA9Q9UGM1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA9Q9UGM1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA9Q9UGM1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms