Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NKX1-2Q9UD57 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms