Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APEX2Q9UBZ4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms