Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL42Q9P2K6 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms