Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLN6Q9NWW5 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms