Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRDE2Q9H7Z3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms