Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZCCHC2Q9C0B9 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms