Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR4

KRTAP4-3, Keratin-associated protein 4-3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-3Q9BYR4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
KRTAP4-3Q9BYR4 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms